Среднее время посещения сайта ниже того значения, которое я указал в настройках.

Что такое среднее значение, для примера:

Среднее значение между 1 секундой и 90 секунд, это 45 секунд.
Между 60 и 30 секунд, 45 секунд.

Таким образом если ваш сайт посетили 100 человек по 300 секунд, и 1 пользователь 20 секунд, среднее значение будет равняться 140 секунд.
Кроме этого различные системы используют различные алгоритмы фиксации времени.